ありがとうございます。非常に参考になりました！
3.0.3 を使っているのですが、
該当する設定項目は見あたりませんでした。
もう管理画面からは設定できないのかも知れません。

実際のソースをみますと app/config/eccube/config.yml に
cookie_lifetime というのがありました。
デフォルトで 0 が設定されており、
これは

> This determines the lifetime of the session in seconds.
> The default value null means that
> the sesssion.cookie_lifetime value from php.ini will be used.
> Setting this value to 0 means the cookie is valid
> for the length of the browser session.

http://symfony.com/doc/current/reference/configuration/framework.html#cookie-lifetime

ということだそうですので、つまりブラウザのセッション
タイムアウトに従うようです。
１時間ほどにしたかったので 3600 と記述することにしました。
ありがとうございました！