当方でも同様の現象が起きました。

EC-CUBE 3.0.15（デフォルトに商品2000件程度入れた状態）
PHP 7.0.15


display_errorを有効にして確認すると以下のエラー。



エラー内容が判明してから、php.ini の memory_limit を少しずつ上げて 1GB まで上げてみましたが上記のとおり改善は見られませんでした。

この時点で cache/twig/production 配下のファイル数は20万程度。


EC-CUBEをデバッグモードにして制作している場合は、キャッシュファイルが貯まらないので、この問題に遭遇しないかもしれません。

解決はしていませんがご参考まで。