一応、英語ベースの EC-CUBE(http://en.ec-cube.net) があるのですが、2013年にリリースされたバージョンで止まっており、現在は積極的に開発されておりません。

引用：

上記のような構成にカスタマイズすることは不可能ではないですが、、
日英の通貨や支払い、在庫や発送の管理、お届け先地域による商習慣の違いなども考慮すると、日英それぞれ別の EC-CUBE をインストールして、必要な部分のみ連携する方が楽だったりもします。

上記のような、きめ細やかなカスタマイズはせず、単に言語を変更したいだけでしたら、 Google 翻訳ツールバーで済ませてしまっている店舗も多いです。