2.2.0-betaのdata/class/SC_Fpdf.phpの172行を見る限り、帳票機能で出力したPDFの「商品単価表示」と「小計表示」にあたる部分は税込金額が表示される仕様のようです。
しかし実際には税が適用されておらず、税抜き金額が表示されています。

　// 税込金額（単価）
　$data[1] = SC_Utils_Ex::sfPreTax($this->arrDisp['price'][$i], $arrInfo['tax'], $arrInfo['tax_rule']);

　// 小計（商品毎）
　$data[2] = $data[0] * $data[1];

◆環境◆
　2.2.0-beta
　PHP 4.4.6
　MySQL 4.1.21