返答ありがとうございます。

こちらの方もまだ解決済みとはなっていないようですが…
とりあえずキャッシュの削除をしてみましたが変化はありませんでした。
dtb_pluginは「返り値が空でした (行数 0)。 (Query took 0.0008 seconds.)」と出てます。

「商品登録はできるのに削除ができませんでした。」という事例になっていますが、私の方は試してみたところ登録・削除共に問題なしでした。
「試しに管理画面から『オーナーズストアから新規追加』ボタンを押すと500エラーとなります。」
こちらは私もエラー画面になりました。
.htaccessに「<Limit PUT DELETE>～」を追加してみましたが、こちらも変化はありませんでした。