[EC-CUBE] EC-CUBE4.0.3　新規インストール
[レンタルサーバ] さくらインターネット

EC-CUBE＆サーバーについて、初心者すぎる、とても恥ずかしい問い合わせで申し訳ございません。

現在、独自ドメインでサイトを運営していまして、近々、さくらインターネットに移転を計画しています。

EC-CUBE4を「ec-cube」というフォルダにインストールすると、https://exp.com/ec-cube/以下に、
EC-CUBEがインストールされ、https://exp.com/ec-cube/へアクセスすれば、
index.phpが読み込まれて、EC-CUBEのトップページが表示されるようになります。

おそらく、これがデフォルトの設定かと思います。

これを、https://exp.com/にアクセスすれば、EC-CUBEのトップページが
表示されるようにしたいと考えています。

そのため、さくらインターネットのサーバー側の設定で、独自ドメインの
Web公開フォルダを「～/www/ec-cube/」に設定すれば、EC-CUBEのトップページが
表示されて、普通なら解決なのですが、ここで問題があります。

現在、独自ドメインでhttps://exp.com/original/というフォルダにあるページが、
検索サイトでは上位に表示されます。

そのため、サーバーの設定を「～/www/ec-cube/」にしてしまうと、
https://exp.com/original/以下のページにアクセスができなくなってしまいます。


そこで、下記のようなカスタマイズは可能なのでしょうか？

1）https://exp.com/にアクセスすれば、EC-CUBEのトップページが表示される

2）https://exp.com/original/以下にあるページも表示できる。

おそらく、EC-CUBEのindex.phpを、ルート直下に移動させる方法だと思うのですが、
その方法が分からないです。

逆に、/ec-cube/のフォルダの下に/original/のフォルダを持ってきて
（サーバー上は「～/www/ec-cube/original/になります」）、Web公開フォルダを
「～/www/ec-cube/」にすれば、/original/フォルダも表示されるので、解決なのですが、
EC-CUBEのセキュリティとしては、どうなのかと気になりました。

セキュリティやカスタマイズの安全性から、EC-CUBEがインストールされているフォルダに、
別のフォルダを作ってしまうのは良いのでしょうか？

問題ないということであれば、それで進めようかとも思っていますし、逆に、
フォルダを作るのは、得策ではないということであれば、index.phpをルート直下に
持ってくる方法はありますでしょうか。

不慣れなので、長文の説明で申し訳ないです。

よろしくお願い申し上げます。