ご返信ありがとうございます！

ご指摘のとおり、同じ商品が複数件出力されていました。。。

//カテゴリの指定
$qb = $this->entityManager->createQueryBuilder();
$query = $qb->select("ctg")
->from("Eccube\\Entity\\Category", "ctg")
->where('ctg.id = :id')
->setParameter('id', $cat_id)
->getQuery();
$searchData['category_id'] = $query->getOneOrNullResult();

ここでカテゴリの指定方法が違っているということでしょうか？

やりたいことは、カテゴリIDに紐づく新着商品10件を取得したいのですが。。。
確かにSQL文で　d1_.category_id IN (86, 85, 84, 83, 82, 81, 80, 79, 78, 77, 76, 75, 74, 73, 72, 71)と複数のカテゴリが指定されています。