>もし上記バッチ処理が設定されているとしたらどのファイルに記述されているかご存知でしょうか。
サーバOSがlinux系であればcronが設定されていると思います。
ご利用のサーバによっては管理ツールから操作できる場合もありますし、SSHで接続してコマンドで操作する必要がある場合もあります。
ECCUBEだけで完結する仕組みではない為、サーバ管理者に確認されるのが良いかと思います。

ただsitemapの生成が定期的でない場合は
ECCUBEのどこかにカスタマイズが加えられている可能性があるかもしれません。
（例えば、トップページにアクセスがあった時にsitemap.xmlを生成する処理がどこかに追加されている等）

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