ご返信ありがとうございます。
参考URLもありがとうございます。参考URLの方法は、結局「ec-cube4のプラグイン管理」からは外れた方法のように思います。
私も最終手段は、CREATE INDEX／DROP INDEX を、どこかに組み込もうかと考えておりました。

しかしふと、公式サンプル「SamplePayment」でカラム追加＋インデックス追加してないか 試しにインストールしてみますと、思った通りdtb_orderへカラムとインデックスが付加されていました。アンインストール時にはカラムもインデックスも削除されます。
まさにこれと同じ事をしたいので、SamplePaymentが何をどう記述しているか調べてみます。分かれば良いのですが・・・

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