プラグイン同士が競合している可能性もあると思います。
tattsu さんの言われている通り、プラグインを停止してどうなるかを確認してみるのが良いですが、これを確認するためにはまずは事象を再現させる必要があります。
注文者さんと同じ商品、同じ操作で現象が再現するかどうか確認してみてください。

ソースを解析する場合は、決済処理の後、クレジットカードであればプラグイン側のチェックアウト処理の後、決済完了時のパーチェスフローや決済完了ページのコントローラーのイベントなどでプラグイン側にてなにか処理が実行されていないかを確認してみてください。

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トエビス株式会社　田中 宏典
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