すみません先ほど間違った内容で書き込んでしておりました。。
下記修正しました。。

サブコメントでscriptタグを有効にしたいです。

・管理画面からデザイン管理＞ページ詳細設定＞商品詳細ページの
<!--★サブテキスト★--><!--{$arrProduct[$ckey]|nl2br|escape|smarty:nodefaults}-->
太字の部分を追記

・data/Smarty/templates/default/admin/products内のconfirm.tpl
229行目
<!--{$arrForm[$key]|nl2br|escape|smarty:nodefaults}-->
太字の部分を追記してFTPでアップ

・同じくdata/Smarty/templates/default/admin/products内のproduct.tpl
349行目
<textarea name="sub_comment<!--{$smarty.section.cnt.iteration}-->" cols="60" rows="8" class="area60" maxlength="<!--{$smarty.const.LLTEXT_LEN}-->" style="<!--{$arrErr[$key]|sfGetErrorColor}-->"><!--{$arrForm[$key]|escape|smarty:nodefaults}--></textarea>
太字の部分を追記してこれもFTPでアップ

上記を行いましてサブコメント欄に
<script type="text/javascript" src="./●●●●.js"></script>
と書き込んで確認ページへ
確認ページでは<script type="text/javascript" src="./●●●●.js"></script>と表示されていますが、いざページ確認すると
#script tag escaped##script tag escaped#が表示されてしまいます。