seasoftさん、ご回答ありがとうございます。
FTPの件は、サポートに確認してみます。

define.phpを始め、本来あるはずのファイルが無かったりと、
私にとっては不思議な状況で困惑しています。
（define.phpに関しては、アップロードが正しくされなかったことも想定し、
Zipファイル内も調べたのですが存在しませんでした。）

どうも、さくら特有の症状のようにも考えられますし、フォーラム
があればそこにも訪ねてみようかと考えています。
ご対応ありがとうございました。