はじめての投稿になります。
Java での仕事ばかりなので、PHP は初心者ですが、
このパッケージを機会に勉強させて頂いています。

さて、このエラーについてですが、MySQL の 4.0.x では
サブクエリが使えないので、現状の INSERT 文だと
エラーになります。
対処方法としては、動的に生成している箇所を固定の
値に置き換えることで可能だと思います。

しかし、初期データのインポートだけの問題ではなく、
パッケージ内部のロジックでサブクエリを使用していたら
結局使えないです・・・。
パッケージの仕様として MySQL は 4.1 以上となっているので、
この辺の絡みもあるのではないでしょうか。

4.1 は文字の扱い方が違っていいところがあまりないので、
5.0 が使えればそちらへの移行がオススメです。
View が使えるのも 5.0 からですし。

見当違いのことを言っていたらご指摘下さい。