すみません。試してみても再現できない為、操作手順ミスを疑ってました。

操作後に
システム設定→パラメータ設定にて以下の値が正しく変更されているかをご確認ください。

TEMPLATE_NAME
MOBILE_TEMPLATE_NAME
SMARTPHONE_TEMPLATE_NAME

通常は自動で正しく変更されるかと思いますが、現象から察するに、MOBILE_TEMPLATE_NAME ではなく、TEMPLATE_NAMEにモバイルで設定したテンプレートの値が設定される。
という形になるかと思われます。