こちらの件、自己解決いたしましたので対応状況を「解決済み」にさせていただきます。
参考程度に情報を記載します。

今回はProductRepositoryをカスタマイズしました。
category_idを引数とし、公開ステータスが「公開」の商品の中でカテゴリが一致する
商品を検索→件数をカウントして有無を返却するようにしました。
あとはtwigファイル内の記述を変更して完了です。