Services_JSONクラスに渡された連想配列をJSONデータに加工しようとしてエラーになっているようですね。

貼りつけていただいた401行目の

return '[' . join(',', $elements) . ']';

ですが、ここでjoin()に渡している$elementsや、その直前の393行目で$elementsを生成している

$elements = array_map(array($this, 'encode'), $var);

という処理でarray_map()に渡されている$varが原因になっていると思われますので、
これらの変数$elements、$varの中身を確認されてみてはいかがでしょうか。

$varが配列であれば、array_map()の第2引数としては正しいものになります。