インターネットオプションと
ツールバーの両方にあるポップアップブロックの設定が正しくされているのであれば・・・

残りは、IEのContent-Type無視問題かな？と思います。

ためしに
インターネットオプション
→セキュリティ
　→[インターネット]
　　(ローカルアクセスなら[イントラネット])
　　　→レベルカスタマイズ

にて以下の項目を[無効]にしてから試してみてはどうでしょうか？
・拡張子ではなく、内容によってファイルを開く

引用：
起きたり、起きなかったりするのが環境問題というものです。

--駄文---
Internet Explorer は多くの人が利用しているのに、一番理解不能でわかりにくい拡張をしているのが特徴だと私は思っています。