ytanaka 様

自分のローカル上で確認致しましたが、
その設定でも出力されることを確認致しました。
設定後は、mysqlを再起動をお忘れなく。


また、以下の記述は「クエリ実行にかかった時間が1秒以上」という条件ですので、
こちらの値をご変更してログを見てみてください。

long_query_time = 1


以上、よろしくお願い致します。