私も同じところで悩んでいます。
接続先URLはテスト環境のものですか？本番環境ですか？
エラー内容はどのように出ていますか？

私の場合はテスト環境のURLを入れたところ「このcgiを実行する権限がありません」と出て登録できません。

どなたか助け舟を出して頂けると助かります。

環境は
イプシロン決済モジュール　Version.1.3
EC-CUBE 2.3.0
DB MySQL 5.0.27
PHP 5.2.6
です。