自己解決しました。

ふとclasscategory_id　１９とは何かと疑問に思い、チェックしました。
すると登録されていないName　NULLで登録されていました。

それを削除すると今度はEC-CUBEの管理画面から商品の新規登録や変更ができなくなりました。

この行は削除するべきではなかったのでしょうか？

ローカルホストの方では
classcategory_id 0
name NULL
class_id 0
status NULL
rank 0
create_date 2009-02-27....
update_date 2009-02-27....
del_flg 0

でした、本来必要な情報のようなのでサーバの方にも同じ情報を追加しました。

すると一応新規登録や変更はできるようになりました。

思わぬ収穫でしたが、これで今までの現象が解消されました。

規格２が表示されなくなり普通に表示されるようになりました。

classcategory_id 0にこの値がなかったのが原因でしょう、何故かclass_id 19に移動していてバグが起きていたのだと思います。