売上集計は処理が重たいので（v2.4.0では改善されたようですが）、１回だけではタイムアウトすることもあるかもしれません。

しかし、システムエラーになったのは気になりますね。
グラフが表示されるものもあるようなので、
GDやFreetypeなどは導入されている感じでしょうし・・・。

EC-CUBE側のシステムエラー表示の場合は、
/data/logs/site.log にエラー内容が記述されているかと思いますので、そちらを掲載してもらうのは可能でしょうか。何かわかるかもしれません。

WEBサーバーが出すエラーの場合は、
そのエラーを掲載してください
（ドメイン等を含む場合でばれたくない場合は伏せてください。）

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