参照先にも書いてありますが、更新は問題無いです
ですが「規格自体の新規登録」は商品登録CSVでは出来ないかと思います。（参照先はそれについてですよね？）

規格設定がある商品IDとセットの規格IDがあるということは、既に規格が設定済みかと思います。

規格設定されていない登録済み商品IDに対して商品登録CSVで規格IDを設定することは出来ないと思います。

混乱しやすい所として、商品登録CSVにおける規格IDとは、規格の種別のID指定ではなく、「個別の　商品＋規格　の組み合わせ設定済み1行の情報」におけるIDという事でしょうかね？

規格の組み合わせ設定自体を新規登録したいという主旨だとしたら流し込みスクリプト作るなり、カスタマイズが必要かと思います

※追記
質問主の方も新規で規格設定したいという意味だったのかな・・・？(汗

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