こんばんわ。

ご質問の「SET SQL_BIG_SELECTS」を記述する箇所についてですが、
2.11系では、/data/class/SC_Query.phpの80行目に
$this->query("SET SQL_BIG_SELECTS=1");
を追加すれば、よいのではないかと思います。
(2.11.1が手元にないので、もしかしたら記入場所が前後するかもしれませんが・・・)

ただ、site.logの内容を拝見したところ、
取り出せるデータ量の限界を超えている旨のエラーが発生している為、
（MAX_JOIN_SIZEの設定値 = MySQLの高負荷防止策）
MySQLには想定以上の負荷が発生する可能性があります。


今までこのエラーが発生した事はないのですが、
商品テーブル、規格テーブルなどのデータ件数はいくらぐらい登録されているのでしょうか？
（特にdtt_products_classテーブルの件数は？50万件？100万件？とかの規模でしょうか？）


あと、現状の改善が無い場合は、サーバーのデータを初期化するという話は、
ファーストサーバーのサポートのほうから連絡が来たのでしょうか？
もし、ファーストサーバー側から、MySQLの負荷の軽減を求められているのであれば、
上記の方法では、根本的な解決にならないかと思います。