在庫を減らす処理を行う直前に、dtb_products_class（もしくはそれに準じるview）を参照して、
商品種別(product_type_id)がダウンロードでない(!=2)場合のみ、メールを送信するようにすればよいかと思います。
在庫を減らす処理は、SC_Helper_Puchase->registerOrderComplete()の中にあるようなので、
在庫現象の成功後に実装すればご希望の動きになると思いますよ。