chocomame様　こんにちは。

質問等が色々ありましたので、順次（私がわかる範囲ですが）
回答を書いていきますね。

引用：

こちらは、可能でしたら該当商品の在庫数の更新などの
オペレーションを行った日時の近辺をご覧頂くと、
何がしかSQLのエラーなどが出ているかもしれません・・・。

"error"の文字列でその日時の近辺を探してみると
見つかるかもしれません。

引用：


ひとまずよかったです。

dtb_products_classの以下の状態を確認しますと



この時点で有効なレコードはproduct_class_idが109、110の
レコードです。
通常の規格削除の処理で、不整合になっていたレコードにも
削除フラグが立ったので、正常に表示されるようになったと
思います。（直接DBをいじらずに済んでよかったです。）

ちなみに、その後に再度規格を登録したということでしたが
（もう戻しましたでしょうか？）その場合、product_class_idが
109、110のレコードのdel_flgも0→1になっていると思いますが
いかがでしょうか。

補足）当方が2.11.3の動作環境を持っていないので確認が
　　　できないのですが、他の規格のない商品につきましても
　　　スクリプト部分に設定されているproduct_class_idは
　　　2つ違う値になっていますでしょうか？
　　　もしそうであれば、問題ないのですが・・・。

　　　以前当方が添付したように、現在のバージョン（2.11.5）
　　　では、product_class_idは1つの値で2箇所設定されて
　　　います。

　　　また、dtb_products_classのレコードも、規格を削除すると
　　　該当レコードは削除フラグでなく、本当に削除されるように
　　　仕様が変わっています。

引用：
今までおかしかったのは、dtb_products_classの状態に
よるものですので、在庫数を0にするだけで問題ないと思います。

引用：

確認の為に規格を設定した際に、上記の情報の状態は
どうなっていたでしょうか？
（きちんと表示、設定されていたでしょうか？）

また、現在有効なdtb_products_classの
・product_code
・price01
・price02
・stock
にはきちんと値が設定されているでしょうか。

あとお手数ですが、再度商品マスタ登録画面から
上記情報を入力し、修正登録をしてみて
状態をご確認頂けないでしょうか。

とりあえず以上です。

また何かございましたら、こちらへコメントを頂ければ
お返事いたします。