念のためサーバー会社に問い合わせてみました。

「max_input_vars」につきましては、
『PHP5.3.9』以降で有効なオプションとなっております。

大変恐れ入りますが、ロリポップ！で提供しておりますPHPは
『PHP5.3.15』もしくは『PHP5.2.17』となっておりますので、
「max_input_vars」に対応しているバージョンではございません。