自己レスになります。

data/class/pages/upgrade/LC_Page_Upgrade_Download.php

のファイルの中の

$objLog->log("* copy batch check start");
if (count($arrCopyLog['err']) > 0) {
$objJson->setError(OSTORE_E_C_BATCH_ERR);
$objJson->display();
$objLog->error(OSTORE_E_C_BATCH_ERR, $arrCopyLog);
$this->registerUpdateLog($arrCopyLog, $objRet->data);
$this->updateMdlTable($objRet->data);
return;
}

バッチ処理チェックの部分(?)をコメントアウトしたところ
とりあえずインストールできました。

「購入商品一覧」のインストール部分も"済み"になり、次の設定まで進めるようになりましたが、このあとの動作についてはまだチェックできていませんし、バージョンアップの際も不安ですので何かあればまた投稿しようと思います。