ご返信頂きまして誠にありがとうございます。

dtb_category_total_count
dtb_category_count

を確認したのですが該当の「新規親カテゴリ」のID自体が存在しておりませんでした。

管理画面では表示されており、csv書き出し時も出力されております。

そこで現在使用していないカテゴリに親カテゴリとして使用しまして、dtb_category_total_countに商品数を入力したら親カテゴリ自体は表示されたのですが、その親カテゴリをクリックすると一覧ページでは該当商品が並ぶのですが、小カテゴリがツリーには表示されず、変更前のカテゴリの所に表示されております。