セッションが正常に開始されていないのではないでしょうか。

以下、SC_SessionFactory_UseCookie.php のセッションまわりのパラメータや、
ini_set('session.use_cookies', '0');
ini_set('session.use_trans_sid', '1');
ini_set('session.use_only_cookies', '0');

SC_Initial.php で error_reporting を以下にするなどしてみてはいかがでしょうか。
error_reporting(E_ALL & ~E_NOTICE & ~E_DEPRECATED);

また、install.php の DOMAIN_NAME の値もチェックしてみてください。

その他、いくつか原因が考えられますが、実際のサイトを見ないと、根本原因はわかりかねます。