umebius様　ありがとうございます。

$productTypes = $Order->getProductTypes();
$orderMailArr = array(
1 => '商品種別1の時に送信したいアドレス',
2 => 商品種別2の時に送信したいアドレス',
3 => '商品種別3の時に送信したいアドレス',
);

if (count($productTypes)) {
foreach($productTypes as $ProductType){
if(array_key_exists($ProductType->getId(), $orderMailArr)){
$orderMailadls = $orderMailArr[$ProductType->getId()];
break;
}
}
}

$message = \Swift_Message::newInstance()
・
->setBcc($orderMailadls)
・
・

で実現できました。


アドバイスを頂く前は、一旦あきらめて
ShoppingService.php側の　sendOrderMail(Order $Order)　の方で

$productTypes = $this->orderService->getProductTypes($Order);
$orderMailArr = array(
1 => 1,
2 => 2,
3 => 3,
);

if (count($productTypes)) {
foreach($productTypes as $ProductType){
if(array_key_exists($ProductType->getId(), $orderMailArr)){
$orderMailadls = $orderMailArr[$ProductType->getId()];
break;
}
}
}
if($orderMailadls==1) {
$message = $this->app['eccube.service.mail']->sendOrderMail($Order);
} else if($orderMailadls==2) {
$message = $this->app['eccube.service.mail']->sendOrderMail2($Order);
} else if($orderMailadls==3) {
$message = $this->app['eccube.service.mail']->sendOrderMail3($Order);
} else {
$message = $this->app['eccube.service.mail']->sendOrderMail($Order);
}

として、MailService.phpに渡し
MailService.php側で、

public function sendOrderMail(\Eccube\Entity\Order $Order)　部分をまるごとコピペして
public function sendOrderMail2
public function sendOrderMail3
を追加し、
それぞれ、 ->setBcc　に、送信したいアドレスを直に指定することで一応、実現はできていました。
これは、メゾットを増やすことで、他に影響を及ぼす箇所があるかもしれない・・・　と不安に思っていました。

アドバイスを頂き、再度、チャレンジしたところ
MailService.phpのみで実現することができました。
ありがとうございました。