サポートスタッフから、
お客様の「アクセスログ」を拝見する限り、
下記のように「オーナーズストアを呼び出すと思われるプログラム」への
アクセス（ownersstore.js.phpへのアクセス）にて「500エラー」
（＝この度ご指摘のエラー）が発生しておりました。

▼アクセスログの一例
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126.117.73.54 - - [10/Sep/2011:01:02:23 +0900] "GET /user_data/packages/default/js/ownersstore.js.php HTTP/1.1" 500 294 "http://******.sixcore.jp/admin/ownersstore/index.php" "Mozilla/4.0 (compatible; MSIE 8.0; Windows NT 6.1; Trident/4.0; GTB7.1; SLCC2; .NET CLR 2.0.50727; .NET CLR 3.5.30729; .NET CLR 3.0.30729; Media Center PC 6.0; .NET4.0C; MANM)"
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お手数ですが、該当ファイル「ownersstore.js.php」が設置されております
「js」フォルダやその上の「default」フォルダのパーミッションを【755】へ、
また「ownersstore.js.php」ファイル自体のパーミッションを644へ変更し、
再度状況をご確認くださいますようお願いいたします。
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と上記のように回答をいただき、早速パーミッションを変更して
再度トライしてみましたが、ダメでした。その旨をサポートに
連絡した所、原因がわからない。可能ならデータ移行を小分けに
してやってみてくださいとの回答を得ました。

うーん、参ってしまいました。