xrea 固有の事象だと思いますので、サポート先に聞くのが良いかと思います。
CGI ラッパーが PHP と識別できていない感じですね。

なお、EC-CUBE SVN 最新版のインストールのみでしたら、無保証ですが無償で承っておりますので、ご入用でしたらお申し付けください。
本日時点で承っているのは、下記のバージョンです。
・2.3.4
・2.4.0-RC2
・2.3.3-comu

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Seasoft
こちらでの投稿は、アイディア程度に留めさせていただいております。
個別案件の作業は有償で承っております。お気軽にご相談ください。