転送速度は通信速度やその他環境などにも依存するので、一概には何とも言えません。

転送の際に、他のプログラムを平行で実行していた場合などは、転送に時間がかかる場合があります。（動画や音楽をダウンロードしながらなど。。）
また、当然ですが一度解凍したファイルでは容量が大きくなりますので、ZIPのまま転送した方が早くなります。

＊次回はご質問の際に、サーバーのスペックなども合わせて記載して頂いた方が宜しいかと思います。（色々とプランによりスペックなども異なるので）