引用：

「参照渡しは不要になるか?」というと語弊がありますが、SC_Query_Ex::getSingletonInstance() によって同一の SC_Query インスタンスを取得可能です。
SC_Query の内部では MDB2 のインスタンスを保持しており、 MDB2 自身も singleton で DB 接続を取得していますので、一貫したコネクションを取得可能です。

引用：

厳密には、 RDBMS のトランザクション分離レベルが適用されます。
通常、 PHP はシングルスレッドで動作しますので、 別のスレッドがアクセスするようなことはありません。
(ISAPI で動作しているような環境は例外ですが)