tsuji様

ご返信ありがとうございます。
apacheを再起動してみましても状況は改善されない状況です。

状況をご説明いただきますと、元々EC-CUBEは2.11系、MySQLで同サーバーにて稼働しておりました。
バージョンアップをする必要がでてきたため、2.12.6をインストールしようと試みました。
ラピッドVPSはInnoDBの動作は非推奨だったためEC-CUBE2.12.6、PostgreSQLの組み合わせでやろうと取りかかりました。
PostgreSQLのバージョンは7系だったため、ラピッドVPSに8系のアップグレードマニュアルありましたので実行、8.4.8にしました。
http://www.rapidsite.jp/support/manual/vps-jp_sj/e_9279.html

EC-CUBEに関してはデフォルトのまま、なにもカスタマイズしておりません。
2.13.1もダウンロードした状態でなにも変更したりはしておりません。
当方もSQLのせいかと思っておりましたが、調べてみましてもあまりこのような報告が引っ掛かってこないため皆さまにご相談しました。