11月4日版のhtml/shopping/payment.phpを修正し、
確かに購入できなくなる不具合が発生しました。
（不正なページ移動）

そこで11月10日版のhtml/shopping/payment.phpを修正したところ、一応購入できるようになっていたように見えましたが、ポイント使用時にエラーが発生してしまうバグがあるようです。
（同じ画面が表示され、ポイントのところには「使用ポイントが購入金額を超えています」のようなコメントが出る）

11月4日修正以前のファイルに戻すと正常動作。

そもそも、11月4日時点では「お支払情報入力ページでのSQLインジェクション 」は「対象:Ver 1.4.8以前」となっていたのに、 11月10日には対象「EC-CUBE1.4.8以降」となっており、対象バージョンも曖昧な感じです。

ちなみに当方では、1.3.2と1.3.4と1.4.8と複数のサイト、３種類のバージョンで同じ不具合を確認できたので、全サイトで11月4日、11月10日の修正項目を書き換えた状態です。

脆弱性に関するものだったので、即対応したのですが他の方は不具合起こってないのでしょうか。