バグではないのですが、適切なカテゴリが無いのでこちらに書き込みます。
現在2.12.1で構築中なのですが、読み込むjQueryのバージョンを初期設定の1.4.2以外にすると、商品一覧ページでカゴに入れるボタンが反応しなくなってしまいます。

1.7.2と1.6.2で試したところ両方カゴに入れるボタンは反応せず、1.4.2にすることで解決しました。

現状致命的な問題とは思いませんが、今後1.4.2までしか対応出来ないとなるとデザイン面での制限が増えてくるかと思います。
今後のアップデートで、せめて今リリースされているjQueryにだけでも対応するように変更して頂けるようご検討ください。

尚こちらの環境はいくつか独自のカスタマイズを含んでいるので、インストール直後の場合発生するかどうかは不明です。
検証できる環境をお持ちの方は情報を頂けると嬉しいです。

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EC-CUBE　2.12.1
確認ブラウザ　Firefox14.01