規格画面は入力フィールドが大量にあり、後半の入力値が欠落する可能性があります。
php.ini の max_input_vars の設定値を増やしてみてはどうでしょうか。

max_input_vars の規定値が1000で、規格1明細行につき10個ほど入力フィールドがあるので、ちょうど100明細ほどでphp.iniの初期値をオーバーしてしまいます。