スレッドの内容を確認しましたが、ブラウザでアクセスした時には正常にページが表示されていますが、
実は裏でエラーが発生しおり、Googleクローラーから見ると、そのエラーが原因で、情報が収集できていないという事だと思います。

スレッドの中で参考にされたサイトがあり、こちらに色々記述されていますが、
Fetch as Googleを実行した後、サーバ側のエラーログを確認して、１つ１つ直していったようです。
http://blog.valid-seo.biz/2014/08/44.html

現象は似ていますので、これが原因のような気がしますが、
その場合、ログを見ながら、個別に直していくしか方法が無いような気がします。

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株式会社シロハチ
■ECCUBE2系、3系構築カスタマイズご相談ください。
■EC-CUBE3マニュアル
■blog

>ECCUBEにはメインビジュアルスライドショー以外にプラグインの導入やカスタマイズはされていますか？


以下のプラグインが”有効”になっております。

SEO管理プラグイン
UA版 Google Analytics eコマース対応 プラグイン
ソーシャルボタンプラグイン
メタタグKeyword自動設定
クロネコwebコレクト決済コア機能プラグイン
複数帳票プラグイン
全ページ対応パンくずリスト表示プラグイン 無料版
メインビジュアルスライドショー
商品画像スライドショープラグイン
売上ランキング
おすすめ商品画像スライドショープラグイン
かんたんに検索条件が増えるプラグイン
商品別コンテンツエリア追加（2.13系）
カスタムメニュー
カートスキップ

ヘッダーやフッターは自分でデザインし直しましたが、これはさすがに影響していないような気がします。


>botを除外する為に、トップページに何か施されていて、誤ってGoogleもはじかれているという可能性は無いでしょうか？


これはプラグインのファイルにGoogleをはじく何かが書き込まれている可能性があるということでしょうか？



下記サイトを見てみましたが、よくわかりませんでした・・・

https://xoops.ec-cube.net/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=16741&forum=10&post_id=73774#forumpost73774

Googleのクローラーが、TOPページのみアクセスできないというエラーは、あまり聞いた事が無いのですが、
ECCUBEにはメインビジュアルスライドショー以外にプラグインの導入やカスタマイズはされていますか？

botを除外する為に、トップページに何か施されていて、誤ってGoogleもはじかれているという可能性は無いでしょうか？

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株式会社シロハチ
■ECCUBE2系、3系構築カスタマイズご相談ください。
■EC-CUBE3マニュアル
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[EC-CUBE] 2.13.1
[現象] SEO対策の一環として、Search Consoleをチェックしているのですが、Fetch as GoogleにTOPページを登録しようとすると、”アクセスできません”というエラーログが出てしまいます。

因みに、他のページ（商品詳細ページ等）は問題なく登録できます。

クロールエラーを見てみても、TOPページがサーバーエラーのところに表示されてしまっています。

色々と調べてみたところ、EC-CUBEのプラグインが影響することがあるようですが、回避策は何かありますでしょうか？

TOPページにのみ影響していそうなプラグインは、メインビジュアルスライドショーです。

スライドショーはどうしても利用したいので、プラグインは有効にしたままでFetch as GoogleにTOPページを登録したいです。