足立です。

こちらRC1版には修正反映済みですので、
RC1版をダウンロードいただき、SC_SendMail.phpだけ上書きすれば修正反映されるかと思います。
http://www.ec-cube.net/download/index.php


もしくは、下記の最下部の「Plain Text」でもダウンロード可能です。
http://svn.ec-cube.net/open_trac/browser/branches/version-2/data/class/SC_SendMail.php

当方もこの症状で困っているのですが、
具体的にどの位置に入れればよいのですか？
閉じPHPの直前に入れればOKですか？

お忙しい所恐縮ですが、ご返答お待ちしております。

私の環境でも、似たような現象になります。（例文のよりは少し長いかな・・・）
そしてメーラーの差出人欄が表示されません。

私が、この表示が出始めた原因は、
新着情報一覧を取り出そうと、コードを書き換えてからです。

ただ、バージョンが1タイプなので、同様にして直るかどうか、
私がコードを触る前に（素人なので）、
ぜひ開発チームの方、ご返答いただけると幸いです。

◇EC-CUBE 1.4.5
PHP 4.4.7
MySQL 4.1.18
firefox　 2.0.0.15　で見ています。

よろしくお願いいたします。

次の環境にて、メールの差出人欄（店舗情報など）に15〜20文字以上の日本語を入れると
途中で文字化けが発生しました。

◇EC-CUBE 2.0.1
CentOS 4.6 (kernel2.6.9)
Apache 2.0.52
PHP 4.3.9
MySQL 4.1.20
Postfix 2.2.10


原因はFromとSubjectのエンコードの際に改行が余分に入ってしまう事で、
メーラーがうまくデコードできないためでした。
(beckyとgmailにて確認)
====================================================
（例）
From: "=?ISO-2022-JP?B?hoge~~~hogehoge=

=?ISO-2022-JP?B?hogehgoe==?="<hoge@example.com>;
====================================================

EC-CUBE 2.1.2aでも同等の現状が発生しましたので、
同様の症状でお困りの方は、次のコード修正で直るかもしれません。
（当方、これで直りました）

対象ファイル：data/class/SC_SendMail.php

$ diff SC_SendMail.php.201 SC_SendMail.php
102c102
< $this->subject = mb_encode_mimeheader($subject);
---
> $this->subject = mb_encode_mimeheader($subject, "JIS", 'B', "\n");
142c142
< $_name = mb_convert_encoding($_name,"JIS",CHAR_CODE);
---
> // $_name = mb_convert_encoding($_name,"JIS",CHAR_CODE);
144c144
< $_name = mb_encode_mimeheader($_name);
---
> $_name = mb_encode_mimeheader($_name, "JIS", 'B', "\n");

＞株式会社ロックオン様
全ての環境で現象が発生するようでしたら、
コードを取り込んでいただけると幸いです。

よろしくお願いします。