[EC-CUBE] 3.0.13 　新規インストール
[レンタルサーバ] さくら
[OS] FreeBSD 9
[PHP] 7
[データベース] MYSQL
[カスタマイズの有無] ほとんど吊るし(トップペーの絵や文言変えた位)
[現象] 沖縄を除き送料を540円に設定しております。注文が入った際に、540円の筈が541円になってしまったり、544円になってしまいます。当座、手動で解決して行くつもりなのですが、どの辺りから見直せば良いのでしょうか？
宜しくお願いします。

追記
注文商品が1点の場合1円多く、4点の場合は4円高く表示されています。