原因が判明しました。
受注情報変更画面において、
お届け先が１件の場合、数量を変更すると、javascript quantityCopyForSingleShipping により、非表示項目のお届け先情報内の数量へコピーしています。
ここで、商品購入にあたり、
受注情報：
　　なべ
　　アイスクリーム
の順番（購入順:dtb_order_detail）になっていますが、
お届け先情報：
　　アイスクリーム
　　なべ
の順番（product_id順:dtb_shipment_item）になっています。
結果、受注情報のなべの数量を変更すると、お届け先情報のアイスクリームの数量が変更されます。

この表示順が一致すれば、問題解決です。

追記：
順番の同期ができれば良いのですが、
できないのであれば、
javascript quantityCopyForSingleShipping をはずして、
以前、提示させていただいたようなコードを追加するような修正になるのでは。

再追記：
これでも、まだ、うまく動作していない。（非表示部分に数量のコピーができない）