snitta さま、

早速のご検証ありがとうございます!

MySQL でも大幅に改善されるとのことで、安心しました。

引用：

そうなんですよね。せっかくファイルポインタを取得しているので fgetcsv() を使用した方がすっきり書けるんですよね。
まだきちんと検証できているわけではありませんが、 そこそこ大きなファイルを扱いますので、 csv の展開もきちんとベンチマークしたいですね。

余談ですが、 mysql_* 系のネイティブ関数を使用した場合は、どれくらいのパフォーマンスになるか興味があります。