nesess様に教えていただいたチケット（#1438）を確認しました。
今回の現象ではdtb_shippingにはそもそも問題の受注の登録が行われていないようです。
dtb_shippingでソースをGrepし確認しましたが、この辺りに特にソース変更されているような箇所はありませんでした。
ただ、教えていただいた障害履歴は今回の件とは全く関係がないとは言い切れないと思いますので、
#1438の変更、LONGTEXT型への変更を行い、しばらく様子を見たいと思います。

ご協力くださった皆様、大変ありがとうございました。