こんばんわ。

ec-cubeの話というよりは、htmlやcssの話だと思われます。
更に、メニューバーのコーディングもそれぞれだと思いますので、正解はひとつではないですよね。
ここでの回答は期待できないかも。
ググれば、そういった内容のページは見つかると思います。
自分がやるとすると、スクリプト側でメニューバーのクラス属性を変更する変数をテンプレに渡してページ毎にメニューバーの状態を変えるようにしますが。

外していたらすいません。（久々のECCUBEなので）

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落ちない様に必死です。