自己レスです
シーケンス名について当方の誤解があるのではと思い始めています。

SC_Query:835 $this->error("setVal -> dropSequence [$seq_name]");
ここでエラーメッセージが出されると思うのですが、表示上は'テーブル名_カラム'で当方がシーケンス名で期待する'テーブル名_カラム_seq'ではありません。

LC_Admin_System_Bkup:592 list($name, $currval) = explode(',', trim($line));
ここで、setValに渡されるシーケンス名$nameを切り出しているように見えます。しかし、'テーブル名_カラム_seq'が得られるようには思えない。'テーブル名_カラム'なら入ってくるかも。

当方がシーケンス名と思っているのはphpPgAdminのシーケンス画面で表示されるシーケンスです。
多分ちがうのでしょうね

ご教授ください。