もう一歩前進

デプロイしたサーバーに ssh で入って eccube_install.php をゴニョゴニョすると DB の初期化ができて動き始めました...が

たぶん App Engine Flex で使うにはデプロイの前に設定ファイルを用意しておく必要がありそうです。あと DB の初期化はどうするのがいいですかね。たぶん事前に作っておくのが良さそうなんですが、ローカルで cloud_sql_proxy 使ってつなげて初期化するんですかね。eccube_install.php が unix_socket 対応してくれると少し楽かも。

「html/install.php は、インストール完了後にファイルを削除してください」と言われるのですが、デプロイしてからでは遅いので先に削除しておく必要がありそうです。

ただ他にも問題がありそうです。App Engine Flexible Environment は Container ベースで、複数のサーバーが立ち上がる可能性もあります。アップロードした画像などが Filesystem に保存されるのでしたら問題で、他のサーバーではそのファイルはありませんし、 Container がリスタートした場合もファイルは失われます。

現状では App Engine Flex でそのまま使うのはちょっと難しそうです。

Single Server で動かすなら現状
https://console.cloud.google.com/launcher/details/click-to-deploy-images/lamp
などを使うのがいいかもしれませんね。