少しだけ注意が必要なのですが、本体のエンティティマネージャには、SoftDeleteFilter(検索時にdel_flg=0を自動でつける)や、SaveEventSubscriber(登録・更新時に自動でcreate_date, update_dateを設定する)が設定されています。

ここで生成したエンティティマネージャはまっさらな状態なので、そういった機構が効きません。

例えば、

のようなとき、本体のエンティティマネージャで処理していれば、create_date/update_dateは自動で設定されますが、新たに生成したエンティティマネージャだと、そういうことはやってくれません。



みたいに明示的にセットしておく必要があります。

検索するときも、単純にfindAll()とかすると、削除済みのレコードも取得できてしまうので、findBy(array('del_flg' => 0))のようにしておいてください。