はじめまして。私もネクストエンジンとの連携について取り組み始めたところで、受注メールでまだ止まっています。

マニュアルに、以下のような案内がありましたが、こちらのことでしょうか？
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http://ストア様ドメイン名/UpdateStock.php
ストア様ドメイン名 の箇所は企業様ごとに異なります。
また、UpdateStock.phpファイルをドキュメントルートに配置する必要はありませんが、 その場合はここで設定する値も適宜変更して下さい。

ここではUpdateStock.phpファイルをドキュメントルートに配置した想定で説明します。
メイン名がstrapya.comの例： http://strapya.com/UpdateStock.php