ご返信ありがとうございます。

/src/Eccube/Controller//ProductController.php

の319行目

$ProductCategories = $Product->getProductCategories();

↓

$ProductCategories = $app['eccube.repository.category']->getList($Parent);

と安易に変更しましたらシステムエラーが発生しました

get($app['eccube.repository.category']);

初心者でいまいち記述の仕方がわからないのですが具体的には
getlistのメソッドはどのように組み込めばよろしいのでしょうか。教えていただけると幸いです。

追記

上記の問題も解決していない中、再度問題が発生してしまい、そちらの意見も聞ければと思い追記します。

親カテゴリ非表示にできたと思っていたのですが、確認の際には管理画面上での登録で分からなかったのですが、
CSVで登録した際に親カテゴリが表示されてしまいます。
CSVで一括登録した際に親カテゴリを非表示にするにはProductController.phpの記述の改変のみでは対応できないのでしょうか？データベースを直さなければ駄目でしょうか？